Como sintetizar mis propias secuencias de DNA?
Y para que necesita uno sintetizar su propio DNA?
Pues para poder hacer organismos "transgénicos" pero no desde el sentido literal de la palabra en el que tomo "un gen" de un organismo y lo hago expresarse en otro.
Aquí se trata de poder sintetizar las secuencias de DNA incluso sin tener el organismo del cuál quiero obtener el gen. Es que por ejemplo quiero expresar una proteína, por ejemplo de seda de araña debería tener la araña para poder extraerle ese gen y eso aparte de ser muy setentero, no debería ser necesario teniendo la información de ese gen en bases de datos.
Pero a diferencia de la secuenciación, en la que las grandes cantidades de dinero en I+D han logrado unos precios por par de bases increíbles y sigue disminuyendo; la disminución en el tiempo de secuenciamiento es la otra variable que ha caído fuertemente, pasar de años a días es un logro increible hace 15 años.
De otra parte la síntesis de DNA no ha ido al mismo ritmo, claro que ha disminuido el costo de par de bases,ha disminuido, peor la tecnología no es tan accesible.
Sin embargo al parecer hay algunas alternativas en el momento para pensar en sintetizar uno sus propias cadenas de nucleótidos:
Azco Biotech inc (http://www.azcobiotech.com) vende unos instrumentos llamados OligoArray que sintetizan 8 x 90,000 olivos en simultánea en menos de 24 horas, sintetizando mas menos 0,1 pMoles de cada oligonucleótido en el array. Aquí los costos son de menos de 0,03 CENTAVOS DE DOLAR, es decir 3 centavos por un oligómero de 100 pb de longitud.
Un aparato de estos debe estar por encima de los 40mil dólares. Lo que lo hace bastante inaccesible, venden modelos de segunda repotenciados a precios qu oscilan entre 7500 a 19000 dólares, que sigue siendo costoso.
Mucho de los costos eran derivados del coste de uso de la patente de Carruthers que ya venció, pero sigue siendo costoso.
Las posibilidades de disminuir de verdad sustancialmente están en el orden de la aplicación de nuevas tecnologías como la planteada por Cambrian Genomics http://cambriangenomics.com/
Sigue el problema de los consumibles, el costo de los reactivos afectando la producción, me imagino que la dinámica del mercado haría bajar costos con mayor oferta de instrumentos (hardware) par síntesis, ojalá el hardware libre entre pronto en estas lides con una propuesta abierta que permita empoderar a cualquiera en este "negocio".
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